Nueva imagenRicardo Alejandro Verdugo Salgado

PhD in Genetics (2008), University of California Davis

Laboratorio de Genética de Sistemas y Genómica Biomédica

Programa de Genética Humana, ICBM

Facultad de Medicina, Universidad de Chile

Tel. (2) 2978 9527

 raverdugo@u.chile.cl

http://genomed.med.uchile.cl

Área Temática: GENETICA

“Nuestro objetivo es entender procesos biológicos responsables de salud y enfermedad mediante el estudio de sistemas completos, a nivel sub o supracelular. Para lograrlo, diseñamos estudios genómicos y transcriptómicos y desarrollamos herramientas bioinformáticas para traducir datos en información.”

Líneas de Investigación:

  1. a) Estudio del genoma en poblaciones con estructuras complejas a consecuencia selección, deriva génica, y procesos de migración y miscegenación.
  2. b) Estudio de la relación entre genotipos y fenotipos complejos mediante herramientas de la genética, genómica y bioinformática.
  3. c) Desarrollo y aplicación de metodologías de Genética de Sistemas para identificar y caracterizar redes de interacción génica que ayuden a explicar la conexión entre variabilidad genética y fenotípica.

Publicaciones Recientes

1.- Gularte-Mérida R, Farber CR, Verdugo RA, Islas-Trejo A, Famula TR, Warden CH, and Medrano JF. 2015. “Overlapping mouse subcongenic strains successfully separate two linked body fat QTL on distal MMU 2”. BMC Genomics. ISSN: 1471-2164. IF: 4.041.

 

 

2.-Verdugo RA, Zeller T, Rotival M, Wild PS, Münzel T, Lackner KJ, Weidmann H, NinioE, Trégouët DA, Cambien F, Blankenberg S, Tiret L. 2013.“Graphical Modeling of Gene Expression in Monocytes Suggests. Molecular Mechanisms Explaining Increased Atherosclerosis in Smokers”. PLoS ONE.ISSN: 0718-560X. IF: 3.534.

 

 

3.-  Leduc MS, Blair RH, Verdugo RA, Tsaih SW, Walsh K, Churchill GA, Paigen B. 2012.“Using bioinformatics and systems genetics to dissect HDL-cholesterol genetics in an MRL/MpJ x SM/J intercross. J Lipid Res.ISSN: 0022-2275. IF: 4.73.

 

4.-  Aylor DL, W Valdar, W. Foulds-Mathes, RJ Buus, RA Verdugo, RS Baric, MT Ferris et al.+32 autores..D Pomp*, D Threadgill,* F Pardo, Manuel de Villena*, G A. Churchill*.2011. “Genetic analysis of complex traits in the emerging Collaborative Cross”. Genome Res. ISSN: 1088-9051.  IF: 13.852.

 

5.-  Leduc MS, Hageman RS, Verdugo RA, Tsaih SW, Walsk K, Churchill GA and Paigen B. 2011. “Integration QTL and bioinformatic tools to identify candidate genes for tryglicerids in mice” J. Lipid Res. ISSN: 0022-2275. IF: 4.73.

 

6.- Leme AS, Berndt A, Williams LK, Tsaih S, Szatkiewicz JP, Verdugo RA, Paigen B, Shapiro SD. 2010. “A survey of airway responsiveness in 36 inbred mouse strains facilitates gene mapping studies and identification of quantitative trait loci”. Molecular Genetics and Genomics. ISSN: 1617-4615IF: 2.831.

 

7.- Leduc MS, Hageman RS, Meng Q,  Verdugo RA, Tsaih S, Churchil GA, Paigen B, Yuan  R. 2010.“Identification of genetic determinants of IGF-1 levels and longevity among mouse inbred strains”. Aging Cell. ISSN: 1474-9726. IF: 5.939.

 

8.- Verdugo RA, Farber CR, Warden CH, Medrano JF.2010. “Serious limitations of the QTL/microarray approach for QTL gene discovery”. BMC Biol. ISSN: 1752-0509. IF: 7.431.

 

9.- Casellas J, Farber CR, Verdugo RA, Medrano JF. 2010. Segregation analysis of a sex ratio distortion locus in congenic mice”. J Hered. 101: 351- 359. ISSN: 1465-7333. IF: 1.969.

 

10.- Verdugo RA, Deschepper CF, Muñoz G, PompD, Churchill GA. 2009.“Importance of randomization in microarray experimental designs with Illumina platforms”. Nucleic Acids Res. ISSN: 1362-4962. IF: 8.808

Proyectos

2012-2014      FONDEF D10I1007: Proyecto ChileGenomico: “GENÓMICA DE LA POBLACIÓN CHILENA: OBTENCIÓN DE PERFILES GENÉTICOS NECESARIOS EN INVESTIGACIÓN CLÍNICA, SALUD PÚBLICA Y MEDICINA FORENSE.” (Inv. Resp. Lucía Cifuentes, Coinv. RAV)

 

2012-2015      FONDECYT Iniciación 11121666: “DISCOVERY OF NETWORKS OF GENE EXPRESSION IN MONOCYTES AND LYMPHOCYTES MEDIATING HDL ANTI-ATHEROGENIC EFFECTS IN HUMANS” (Investigador Responsable).

 

2012-2015      FONDEF D11I1029: “INCORPORACIÓN DE LA SECUENCIACIÓN DE ÚLTIMA GENERACIÓN EN EL CUIDADO DE LOS PACIENTES CON CÁNCER” (Investigador Principal).

 

2013-2015      U-Redes (VID, U. of Chile): “BioMed-HPC: RED DE BIOLOGÍA Y MEDICINA COMPUTACIONAL DE ALTO RENDIMIENTO” (Co-Director)