Programa de Biología Celular y Molecular, ICBM
Facultad de Medicina, Universidad de Chile
Independencia 1027
Independencia, Santiago
Chile
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Oficina: 562-29789584
Laboratorio: 562-29786073
Líneas de Investigación
Las bacterias, al igual que el resto de los organismos, deben adaptar su proteoma a diversos cambios ambientales. Uno de estos cambios es el estrés oxidativo bajo el cual se pueden dañar proteínas, lípidos y ácidos nucleicos entre otros componentes celulares. En general, se considera que la adaptación a esta condición depende de la regulación de los niveles de transcritos por factores transcripcionales como OxyR y SoxR. Sin embargo, se desconoce el papel que juega la maquinaria traduccional en este proceso. Por ello, el objetivo de nuestro grupo es estudiar los efectos del estrés oxidativo sobre la traducción en bacterias. Para esto utilizamos técnicas “clásicas” de genética y biología molecular. Adicionalmente, desarrollamos nuevas técnicas para la búsqueda de sitios de oxidación en mRNA, la evaluación del estado de los tRNA in vivo y la estimación de la eficiencia de traducción de los 61 codones bajo diversas condiciones de cultivo. Para ello utilizamos diversas aproximaciones incluyendo secuenciación masiva (tipo Ilumina), análisis bioinformático y de genotecas de diversos patrones de codones fusionados a GFP.
Se espera que el proyecto ayude a comprender mejor la fisiología del estrés y las estrategias que las bacterias utilizan para modular la respuesta a agentes oxidantes que encuentran en el medio ambiente o cuando se enfrentan al sistema inmune.
Financiado por Conicyt de Inserción en la Academia (79130044) y Fondecyt Iniciación (11140222)
Publicaciones Recientes
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* Corresponding author